Zwergflamingos sammeln sich zur Brutzeit in Kolonien von vielen tausend Vögeln. Es können Kolonien von über einer Million Vögel beobachtet werden. Sie bilden Paare, die gemeinsam das aus einem Schlammhügel bestehende Nest bebrüten. Nach der Brutzeit lösen sich die Kolonien teilweise auf und die Vögel ziehen in andere Regionen.