Flachlandtapire sind Einzelgänger. Die Geschlechter treffen sich nur zur Paarung, danach geht jeder wieder seines Weges. Das Jungtier bleibt etwa 10-11 Monate bei der Mutter.
Junge Tapire tragen für etwa 5-8 Monate ein geflecktes Jugendkleid, das sie im dichten Unterholz fast unsichtbar macht.